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肝硬化的病因主要是湿邪。湿有内外之分，外湿为感受六淫之湿邪，内湿为饮食不节，脾失健运而化生。
外湿多伤人皮肉筋骨，内湿多伤人脏腑。肝硬化主要是内湿为病，在南方多湿热兼夹为患，因饮食不节，多食油腻、甘甜、冰冻之品，损伤脾胃，湿停中焦而发病。
其依据有三：一是肝硬化的临床表现是一派湿邪困脾或脾胃湿热的，如腹胀尿少，大便溏泻，肢体困重，食欲不振，舌苔腻等;或见腹胀，尿少而黄，胸闷，恶心呕吐，大便臭秽不爽，舌苔黄腻等。
二是肝硬化多由肝炎、酒精中毒，血吸虫病发展而来，此三者都属于中医湿病之范畴，肝炎多表现为湿热，且易发黄疸，“黄家所得，从湿得之”;饮酒过度，亦滋生脾胃湿热;血吸虫病多为居住水域丰富、地理潮湿之地或长期涉水者易得此病。
三是祛湿法肝硬化有效，尤其是肝硬化初期，湿褪苔净则其病减轻。
由于湿邪久羁，易伤脾，脾虚则运化失职，而病及其他脏腑。肝脾关系为密切，脾虚则肝旺，肝旺则乘脾，如出现腹胀，痛无定处，痛连两胁或少腹，面色苍黄，脉弦等;脾虚则肺亦虚，脾属五行之土，肺属五行之金，土不生金，则易、汗出恶风，气短，右手寸脉弱或浮;脾病可及肾，肾属五行之水，十虚不能制水，可见小便不利、腰酸耳呜，两手尺脉均沉;脾虚不能化生气血，心无所主，可出现心慌心悸、神志改变等。
可见随着肝硬化病情的发展，初期病位在肝脾，而后连及肺、脾、肾，这也体现了中医的整体观念。但病变的重点在肝脾，随着脏腑功能的失调，一些病理产物也相继产生，如痰饮、水气、瘀血等，这样就形成了本虚标实，虚实错杂之证。
李亚磊院长表示：道德经中说道生一，一生二，二生三、三生万物，中医肝病的过程中，发现万事万物都可遵循这个规律，龟源治肝七法中每一种方法都有3味主药，“龟源治肝七法”并非独立配伍，而是根据病人的病情“七种方法”进行辨证施治，加减化裁，结合的辅助针对肝病患者取得了很好的效果。
